黑科技赋能NGS,至本推出行业首个基于基因变异的CUP预测模型
2021-03-18
导读
1、通过全面的基因检测和人工智能黑科技的结合,至本医疗可提供对原发灶部位的有效预测,预测准确率高达83.2%。
2、85% 的原发灶不明癌(CUP)患者可以通过全面的基因检测找到用药机会。
为何原发灶不明癌(CUP)难以诊断
现有癌症诊疗体系中,明确原发部位仍是进行标准化治疗的基础,但是,在临床上仍有3~5%的癌症是无法确定原发部位的,他们称之为原发灶不明癌(Cancers of Unknown Primary,CUP)。
原发灶不明癌(CUP),是指一类经病理学诊断确诊为转移性,但是经过详细检查和评估仍无法明确原发部位的癌症,是最常见的十大癌症之一,死亡率位列第4。1
由于癌症原发部位的诊断是指导临床治疗的重要依据,因此原发灶不明癌(CUP)的治疗策略一直是临床难题,尚无标准治疗方案。
为何原发灶不明癌(CUP)难以诊断?可能的原因有如下几点:
(1)可能原发肿瘤很小,生长缓慢,通过现有的影像学或其他检测技术检测不能发现;
(2)转移的肿瘤细胞可能改变了外观,因此可能不再像原发部位的肿瘤(即分化差或未分化);
(3)原发灶被人体的自身免疫系统消除了;
(4)原发肿瘤在手术中被切除,而医生并不知道这是肿瘤(未做组织学检查)。
此外,原发灶不明癌(CUP)的诊断对于临床医生来讲是一项巨大挑战。很多时候即使通过影像学、病理学、免疫组化等评估,仍无法精确诊断其肿瘤来源,甚至造成诊断错误,对临床医生制定治疗方案造成很大的困扰。
为何要鉴定肿瘤原发部位?
临床肿瘤诊断技术在过去几十年中有了很大的改进与提高,但是,原发灶不明癌(CUP)的起源鉴定还是临床挥之不去的问题,如果能够明确肿瘤的原发部位,有助于临床医生制定针对性的治疗方案,同时缓解患者的消极情绪。
诊断原发灶不明癌(CUP)的意义
(1)原发灶不明癌(CUP)的治疗主要以经验性化疗为主,患者预后普遍较差,所以需要明确原发部位;
(2)准确地了解肿瘤原发部位及组织类型,即可按照原发肿瘤的类型进行治疗,有助于医生选择最合适的治疗方案;
(3)病人可受惠于:减少重复的检测、检查、影像、活检等;有机会进入适当的临床试验;评估癌症的家族风险。
至本数据:85%的CUP患者可以通过基因检测找到用药机会
至本医疗科技CEO王凯博士作为共同第一作者在《JAMA Oncology》发表了一项针对原发灶不明肿瘤的研究[2],通过对200名原发灶不明肿瘤(CUP)患者的基因测序结果进行分析,显示有85%(169/200)的原发灶不明肿瘤(CUP)患者可以通过全面的基因检测找到可靶向的基因变异,而在原发灶不明的腺癌(ACUP)中有72%的患者存在临床上常见的络氨酸激酶(RTK)/RAS信号通路上的基因变异(如ALK, ARAF, BRAF, EGFR, FGFR1, FGFR2, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, NF1, NF2, NRAS, RAF1, RET和 ROS1等)。
行业首个基于基因变异的黑科技CUP预测模型,验证准确率83%
随着生物技术在医学领域的快速发展和人们在细胞分子水平对肿瘤发病机制认识的深入,肿瘤诊疗已经进入了全新的基因组时代。那么,在基因组时代下,原发灶不明癌(CUP)之谜是否可以解开?还是依然存在?
至本在行业内推出首个基于基因变异的CUP预测模型,通过全面的基因检测和AI人工智能技术的结合,辅助临床医生,为原发灶不明癌(CUP)患者提供更精准的临床治疗策略,获得更大化临床获益。
全新的至本CUP预测模型,主要针对原发灶不明癌(CUP),可根据申请出具预测报告。该模型基于内部大量数据集开发,可以凭借人工智能技术从医学典籍中提取内容相关的信息。基于至本自有的知识平台(包括:高质量的期刊文献、指南、基因变异数据库和临床试验信息),基因变异的信息分析可以快速高效的完成。
至本基于基因变异的CUP预测模型,适用于至本旗下的多款大panel检测(包含至寻WES+,元溯,元溯IO,元溯S,元溯GU),可以支持24种常见肿瘤类型的预测,包含非小细胞肺癌、结直肠癌、乳腺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、胃癌、肝细胞癌、软组织肿瘤等,提供对原发灶肿瘤类型的有效预测,明确病理,辅助临床诊断,验证综合准确率达83%。
通过至本CUP预测模型,无需额外检测和费用,预测更加简单快速,1-2 分钟即可出具结果。
此外,至本CUP预测模型基于全球领先的肿瘤基因信息+数万例中国肿瘤数据,通过对基因信息和临床信息的整合分析,为没有可用药基因突变的原发灶不明癌(CUP)患者提示原发灶的位置,从而协助临床医生选择更合适的化疗方案。
例如,对于下面这位多发转移、原发灶不明的男性患者,送检取样部位为膀胱,通过至本医疗的NGS元溯GU检测,发现不存在可用药基因变异、TMB-L、MSS 且HED-L。
基于送检样本的基因变异结果,通过模型预测,相似度排序前三肿瘤类型为:结直肠肿瘤(相似度0.905)、胰腺癌(相似度0.029)、非小细胞肺癌(相似度0.023)。用药机会。
基于至本CUP预测模型,我们可以分析出患者最有可能的原发灶位置为结直肠(概率最大的前三个原发灶部位如下图)。
基于该分析结果,结合临床实际情况,相比于其他化疗方案,结直肠癌一线化疗方案FOLFORI/FOLFOX 有望为患者带来更大的临床获益。
至本引领NGS走向黑科技时代
作为率先在国内完成CAP/CLIA“双C”认证、产品验证以及临床验证等全面体系建设的肿瘤精准医疗公司,至本医疗立足于患者获益需求,以领先的医学洞察、独创的生信算法和AI人工智能技术,始终致力于提升肿瘤患者的临床获益。
未来,至本医疗将继续推动检测技术、生信算法和AI人工智能技术的不断迭代和优化,持续助力肿瘤精准诊疗,更好地帮助医生,提高患者生存希望。每一次检测都能提供全面、准确的分子水平信息,不遗漏任何临床获益机会,至本检测“一次就够”!
参考资料:
1.陈金影,徐清华,原发灶不明转移癌的临床诊断,分子诊断与治疗杂志 2016 年 3 月 第8卷 第2期
[2] Ross Jeffrey S,Wang Kai,Gay Laurie et al. Comprehensive Genomic Profiling of Carcinoma of Unknown Primary Site: New Routes to Targeted Therapies.[J] .JAMA Oncol, 2015, 1: 40-49.
小至 2021-03-18
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